L’équité au niveau du genre est une préoccupation centrale du Projet ALEF.
Le Projet ALEF favorise les approches qui donnent une chance égale aux filles. Il encourage la réussite des filles au collège et dans leur formation professionnelle notamment en leur offrant, dans les régions cibles du projet, un environnement propice à la poursuite de leur éducation (foyers de jeunes filles, octroi de bourses).
Le Projet ALEF s’est également donné pour mission de promouvoir l’alphabétisation des mères, fondée sur la "Moudawana", et de les encourager à s’impliquer plus efficacement dans la vie scolaire de leurs enfants.